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提取病毒RNA的實驗方法

Release Time:2020-07-22

一、病毒RNA提取方法介紹
提取病毒RNA的方法主要有一下三種:異硫氰酸胍提取病毒RNA法TRIzol LS提取法、Trizol提取病毒RNA法等。

 

二、提取病毒RNA的實驗試劑和耗材
序號 產(chǎn)品 CAS號 貨號 備注
1 異硫氰酸胍 593-84-0 SS4104  
2 異丙醇 67-63-0 JT25997  
3 氯仿 865-49-6 DD0008  
4 乙醇 64-17-5 JT26000  
5 焦碳酸二乙酯DEPC 1609-47-8 JT22499  
6 1.5ml滅菌離心管   F-EP015-H  
以上為病毒RNA提取方法所用試劑和耗材,請選用高品質(zhì)的范德生物的生化試劑。
三、異硫氰酸胍的提取病毒RNA的實驗步驟
1.取200ul樣品+陰性對照+陽性對照,加入1.5ml無菌范德生物離心管;
2.加入600ul異硫氰酸胍,然后加入對照和樣品,再加入200ul氯仿,顛倒混合;
3.以13000rpm離心15分鐘;
4.離心第三步結(jié)束時,取相同數(shù)量的1.5ml無菌范德生物離心管,并加入在-20℃預(yù)冷的400ul異丙醇。
5.從離心第三步中取出上清液(確保不要吸收中間的白色層,并且在離心第三步后取出試管時,不要傾斜試管),將其轉(zhuǎn)移到準備好的試管中在第4步中,將其倒置混合;
6.以13000rpm離心15分鐘,輕輕倒出上清液,并在吸水紙上盡可能干燥液體。
7.加入600ul的75%乙醇,并顛倒數(shù)次,以洗滌剩余的異丙醇;
8.以13000rpm離心15分鐘,輕輕倒入上清液,并嘗試在吸水紙上干燥液體。
9.以4000rpm的速度離心10秒,將管壁上的剩余液體搖至底部,用微量移液器吸頭,并在室溫下干燥2-3分鐘(不要太干以防止RNA不溶于下一步);
10.加入20ul DEPE水(在高壓下加入depc純水后的水為DEPE水),輕輕混合以溶解RNA。以2000rpm的速度離心5秒,然后保存在冰上備用(最好在2小時內(nèi)使用以避免RNA降解)。
四、TRIzol LS提取病毒RNA方法
提取物是血清,血液,細胞培養(yǎng)液,雞胚尿囊液和其他液體中的病毒。應(yīng)在人少的情況下進行提取,以防止空氣中RNase的污染。所用的一切也應(yīng)不含RNase。
1.將500ul病毒原液加入1.5ml范德生物離心管中,然后加入500ul TRIzol LS,充分混合,然后在室溫下放置10分鐘;
2.加入200ul氯仿,蓋上離心管蓋,用力搖晃離心管(溶液已完全乳化,呈乳白色,無相分離現(xiàn)象),并在室溫下放置10分鐘(因為氯仿具有沸點低且易揮發(fā),搖動離心管可能會破裂(小心);
3.在4°C下以13000r / min的轉(zhuǎn)速離心15分鐘,吸收上層液相并將其轉(zhuǎn)移到另一個試管中(不要抽吸白色中間相);
4.加入等體積的異丙醇,輕輕倒轉(zhuǎn)離心管以充分混合液體,然后在室溫下放置10分鐘;
5.以13000r / min在4℃離心15分鐘。 (乍看之下,您會發(fā)現(xiàn)試管中什么也沒有。如果仔細觀察,您會發(fā)現(xiàn)試管底部附近的壁上有白色沉淀物。)小心吸掉所有上清液;
6.用1ml的75%乙醇洗滌,在4℃以8000r / min的速度離心10min,(然后您會發(fā)現(xiàn)試管再次是空的,不用擔心,有,但是因為量太小,您看不到)。干凈,在超干凈的臺中干燥5分鐘;
7.加入適量的DEPC處理水。 (如果材料來源豐富,則添加的水量是下一步RT的總量減去其他試劑的量;如果要節(jié)省使用量,您可以自己動手做,盡量不要添加過多水);
8.建議立即進行RT。如果要儲存,則可以在上一步中添加乙醇后將其冷凍在-70°C下,并且可以保存一年;如果添加DEPC水,則只能在-20°C下保存約1個月。
五、Trizol提取病毒RNA方法(提取禽流感病毒的步驟供參考)
Trizol方法適用于人類,動物,植物以及微生物的組織或細菌培養(yǎng)。一般選擇樣品量可以從幾十毫克到幾克不等。
1.取雞胚尿囊液,加入5-10倍體積的Trizol液,然后攪拌均勻;
2.在室溫條件下放置大約5分鐘,然后以每1毫升Trizol溶液0.2ml的比例加入氯仿,蓋緊離心管,用手劇烈搖動離心管15秒鐘;

3.將上層水相放入新的離心管中,以每毫升Trizol溶液0.5毫升異丙醇的比例添加異丙醇,在室溫下放置10分鐘,然后在12000克下離心10分鐘;
4.棄去上清液,每毫升Trizol溶液加入至少1ml的75%乙醇,充分混合,并在4°C下以7500g離心5分鐘;
5.重復步驟4;
6.小心丟棄上清液,然后在室溫下干燥5-10分鐘。注意不要將其過度干燥,否則會降低RNA的溶解度。
7.然后將RNA溶解在水中,靜置10分鐘。

六、提取病毒RNA實驗的注意事項
1.在整個實驗操作過程中,請戴好口罩和一次性手套,并盡可能降低操作強度;
2.加入氯仿前的勻漿可以在-70°C條件下保存約1個月以上,在70%乙醇中沉淀的RNA可以在4°C下保存1周,在-20°C下保存1年。


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