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乙二醛化RNA的瓊脂糖凝膠電泳

Release Time:2022-10-13

RNA的制備:
1. 應該確保RNA在無鹽狀態(tài)下:用70% 冰涼的 乙醇(EtOH) 清洗至少兩次。如果你仍然可以觀察到一個相當大的鹽顆粒,然后用冰涼70%EtOH重新沉淀清洗。
2. 在室溫下風干顆粒至少30分鐘。
3. 在3.7 ml H2O(最多20 mg)中重新懸浮RNA顆粒。
    然后添加:
                     ※ 2.7 ml 6 M乙二醛
                     ※  8.0毫升二甲基亞砜
                     ※  1.6毫升0.1M NaH2PO4(乙二醛應在任何類型的離子交換樹脂上去離子,如BIOFOUNT 提供的樹脂。將等分樣品儲存在-20℃的密封管中。)
4. 在50℃條件下培養(yǎng)1小時。
5. 加入5g 50%甘油、0.01%溴酚藍、0.01%二甲苯氰醇FF溶液。
凝膠的制備:
1. pH 6.8條件下,在10mM NaH2PO4溶液中準備1.4%的瓊脂糖凝膠。溶解瓊脂糖后,允許冷卻至70℃,然后添加 SDS 至0.1%最終濃度;
2. 凝膠在125V 條件下運行3小時。凝膠運行期間,緩沖液必須循環(huán)。
RNA可視化:
1. 將凝膠浸泡在50mM NaOH溶液中,輕輕搖晃大約20分鐘。
2. 將凝膠浸泡在 TBE 或TAE+1 ug/ml EtBr 溶液中,輕輕搖晃大約20分鐘。
3. 在紫外燈條件下拍照。
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